関ヶ原の戦いより数年後、徳川家康の側近である天海僧正は、幕府存続の為に強大な忍者軍団を形成し、関東一円を支配しようとしていた。一方、関ヶ原の戦いで豊臣方に付いた忍びの子孫である彩芽(あやめ)、サツキ、楓(かえで)は、疫病による村の滅亡を食い止めようと、別藩に助けを求め奔走するが…。凄味を増した忍戦帖シリーズ第3弾