車や新幹線などがロボットに変形・合体するヒーローアニメの定番「超生命体トランスフォーマー」シリーズの一作。機械惑星セイバートロンでは、正義のサイバトロンと悪のデストロンが星の支配権を巡って、長い間戦いを続けていた。ある日、マイクロンの存在を知らせる信号が両陣営に届く。これまで行方不明だったマイクロンが、地球で眠りから目覚めたのだ。先を争って地球に向かうサイバトロンとデストロン。はたして新たなる力・マイクロンを手に入れるのはどちらか…。