東京月島の運河に、病院の事務責任者・田久保涼子（岩本千春）の溺死死体が上がった。涼子が勤める武田メディカルクリニックは、院長の武田信太郎（布施博）の経営手腕が注目される反面、多くの医療事故訴訟も抱えていた。涼子は武田の右腕として、それらの裁判を病院側に有利になるよう進めており、病院と武田、涼子を恨む者は多い。涼子の足取りを調べた十津川警部（渡瀬恒彦）は、奇妙な事実に直面する。運河での死亡推定時刻に、涼子は「寝台特急はやぶさ」に乗っていたというのだ。車掌の証言と車内に残っていた指紋がそれを裏付ける。 　　一方、東京駅の監視カメラには涼子の他にも二人の意外な人物が映っていた。弁護士・高木美奈子（沢田亜矢子）と十津川の恩人でもある元刑事の大野雄吉（江原真二郎）である。高木と大野も涼子と同じはやぶさに乗り合わせており、二人は武田メディカルの事故で家族を失った被害者でもあった…。