U.C.0096 ――。ネオ・ジオン軍と地球連邦軍が戦火を交えた『シャアの反乱』から3年。 　　開放されれば地球連邦政府を転覆しかねない、といわれる『ラプラスの箱』の譲渡を決意したビスト財団の宗主サイアムは、現当主のカーディアスに、ネオ・ ジオン残党軍の『袖付き』との会談を計画させる。だが、『箱』の流出阻止を企図した連邦政府は、特殊部隊エコーズとロンド・ベル隊を派遣。両勢力の戦闘は、工業コロニー〈インダストリアル7〉に惨禍を及ぼす。 　　今際の際のカーディアスから、『ラプラスの箱』の『鍵』となるモビルスーツ《ユニコ-ン》を託された 少年バナージ・リンクスは、『袖付き』のマリーダ中尉が駆る《クシャトリヤ》と交戦後、ロンド・ベルの強襲揚陸艦《ネェル・アーガマ》に拿獲されてしまう。その艦には、バナージの友人タクヤとミコットと共に、『箱』の譲渡を阻止しようとしてカーディアスと接触した少女オードリーも収容されていた。その《ネェル・アーガマ》に対し、単機で挑みかかるモビルスーツが出現する。《シナンジュ》と呼ばれる真紅の機体を駆る人物こそ、『シャアの再来』 の二つ名を持つ『袖付き』の首魁、フル・フロンタルだった―。 　　身为毕斯特财团家主的卡帝亚斯（Cardeas），在临终前将作为「拉普拉斯之盒」的钥匙的机动战士——独角兽托付给了年轻的巴纳吉。在与「袖章」驾驶员——玛莉妲·库鲁兹（Marida Cruz）和她的刹帝利（Kashatriya）交战后，巴纳吉被隆德·贝尔（Londo Bell）所属的攻击型登陆舰「拟·阿卡马（Nahel Argama）」所捕获。同样在舰上的还有巴纳吉的朋友拓也（Takuya）和米寇特（Micott）以及为试图阻止「盒子」的交接而与卡帝亚斯接触的少女——奥黛丽·本。 　　敌方的一台MS单独对「拟·阿卡马」发动了攻击。这台红色的MS就是新安州（Sinanju），而他的驾驶者弗尔·伏朗特（Full Frontal）——作为「袖章」的领袖，同时也是被称为“夏亚再世”的男人。 　　（2010.10.30 PSN在线配信 11.12正式发售BD&DVD）